L'enseignement pré-gradué aux étudiants en médecine porte essentiellement sur l'aide à la recherche d'informations médicales, dans le cadre de l'apprentissage par problèmes.

L'enseignement post-gradué et professionnel est en plein développement. Depuis septembre 2002, le SIM organise un certificat de formation continue universitaire en informatique médicale.

D'autres cours spécialisés, pour les radiologues, les techniciens en radiologie médicale sont également offerts.

Le SIM propose des places de stage et de thèses de doctorat en informatique médicale.

Enfin, le SIM développe un réseau de téléenseignement et de téléconsultations médicales, en particulier en Afrique Occidentale.